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常用的遗传学检测方法有形态学检测法（毛色基因测试法、下颌骨形态测量法）、细胞学标记检测法（染色体核型、带型）、皮肤移植法、生化标记检测法、分子生物学检测法。其中前四种均属于间接的遗传检测方法，基本原理则是通过一些可观察的表型来追踪对应的基因变化，如形态学检测法是利用一些具有高度遗传性和品系特异性的外部形态特征来判定。此类检测方法的优点是方便快捷，可操作性强，是应用较为广泛的传统检测方法。但缺点也比较明显，就是准确度较低，局限性强。如毛色基因测试法仅能检测出少量与毛色有关的基因纯合子。与前四种不同的是，分子生物学检测方法则是在基因组水平上对不同发育时期的个体、器官、组织、细胞进行检测，能直接反映出生物个体或种群间的DNA序列的差异性，准确性高，遗传稳定性强，是近交系动物遗传检测最直接最客观的途径。常见的分子生物学标记技术有微卫星标记、随机扩增多态性RAPD、SNP标记、线粒体DNA遗传标记等。

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